內設14個機構，即：哲學與馬克思主義基本原理、經濟學與生態文明、黨史與黨建、政治學與法學、科技與管理學、統一戰線與文化等6個教研室和辦公室、組織人事處、后勤與財務管理處等3個行政后勤處室及教務教研處、科研與決策咨詢處、對外交流與培訓處、圖書與信息管理處、學員工作處等5個教輔處室。另設機關黨委，同時設立三元分校分支機構及三明市守正培訓中心。
